Voedsel dat in de magnetron klaar gemaakt is kan het menselijk elektromagnetische veld onderuit halen. De magnetron produceert radiofrequentie(micro)golven: ultrakorte golven van elektromagnetische energie die zich verplaatsen met de snelheid van het licht. Microgolven uit de magnetron hebben een frequentie van 2,45 gigahertz en een golflengte van twaalf centimeter.

Bij de genoemde frequentie van 2,45 gigahertz neemt water de elektromagnetische energie het beste op zodat het voedsel snel opwarmt. Zonlicht heeft een frequentie tussen 3 en 300 gigahertz. De zon zendt golven van variërende golflengte uit in steeds dezelfde richting. De magnetron produceert snel alternerende velden, waardoor polaire (water)moleculen en ionen in voedsel zich 2,45 miljard keer per seconde moeten draaien, door deze enorme frictie ontstaat warmte. Uit onderzoeken is onder meer het volgende bekend:

• De Zwitserse voedingstechnoloog Hertel vond bij een proef met lichtopnemende bacteriën in het voedsel dat ze extra licht gingen geven bij voedsel dat bereid was in een magnetron.
• De Amerikaanse wetenschapper William Kopp verzamelde gegevens van het Instituut voor Radio Technologie in Kinks in Byelorussia en vond dat in de magnetron bereid voedsel:
  • vaker kan leiden tot immunologische en hormonale problemen, vermoeidheid, maagdarmkanker, spijsverteringsproblemen en psychische klachten.
  • een beduidend lagere voedingswaarde heeft (o.a. van de flavonoiden, vitamine B 12).
  • kankerverwekkende stoffen bevat.
  • vrije radicalen (stoffen die de verschillende lichaamsprocessen danig kunnen ontwrichten) bevat.
  • de chemische structuur van voedsel verandert waarbij door deformatie nieuwe onbekende structuren ontstaan (bepaalde verbindingen in fruit worden op afwijkende manier afgebroken, aminozuren veranderen in hun ruimtelijke structuur).
  • de hoeveelheid E-colibacteriën veel hoger ligt (proef met melk).

Voedsel wordt ongelijk verwarmd, waarbij sommige delen eerder oververhit en andere onderverhit raken. Dit leidt tot vorming van giftige verbindingen die ontstaan door reacties tussen suikers en vetten, eiwitten of nucleïnezuren (versuikering). Daarnaast is de kans op voedselinfecties door deze vorm van verhitting toegenomen. Veel mensen gebruiken de magnetron om voorverpakte kant- en klare maaltijden op te warmen. Uit de verpakkingen kunnen schadelijke stoffen in het voedsel terechtkomen. Tevens bevat dit gemaksvoedsel vaak veel additieven (E-nummers).

Ook de directe blootstelling aan magnetronstraling baart zorgen. De magnetron produceert een krachtig elektromagnetisch veld wanneer deze aanstaat. Veiligheidshalve wordt door de Amerikaanse overheid vooral aan zwangere en kinderen geadviseerd minimaal een armlengte afstand te houden bij gebruik van een magnetron.